Episodio 2 - Finalmente Greymon
 

Nel tentativo di scappare da Kuwagamon, i bambini sono bloccati da un precipizio. Per poter fuggire saranno costretti a lanciarsi nel fiume sottostante, ma grazie all'intervento di Gomamon e alla sua capacità di comunicare con i pesci, i sette bambini con i loro Digimon riusciranno a salvarsi. Raggiungeranno così una spiaggia, così scopriranno la presenza di alcune cabine telefoniche; nel tentativo di telefonare a casa, saranno attaccati da Shellmon. Per salvare Tai, Agumon digievolverà in Greymon sconfiggendo così Shellmon.
 

Episodio 3 - Una notte indimenticabile

I bambini e i loro Digimon incontreranno un arrabbiato Monochromon, che combatte con un suo simile per la difesa del proprio territorio. Andranno così via e scopriranno la presenza di bus al centro di una lago. Ormai vicini alla notte decidono di usare il bus per trascorrere la notte, senza accorgersi che il loro riparo si trova su un Digimon gigante chiamato Seadramon. Gabumon si trasformerà in Garurumon e sconfiggerà Seadramon.
 

Episodio 4 - Sora in pericolo

Seguendo la linea telefonica i sette bambini con i loro Digimon raggiungeranno un villaggio di Yokomon ai piedi del monte Miharashi, un vulcano custodito dal Digimon Meramon. Quando Meramon verrà colpito da un Black Gear (Ingranaggio Nero) il suo comportamento diverrà violento. I Digimon tenteranno di fermarlo, ma i loro colpi non faranno altro che aumentare la sua potenza. Biyomon realizza che Sora è in pericolo così digievolve nell'uccello di fuoco Birdramon il quale riuscirà a togliere il Black Gear da Meramon e a riconsegnarli il proprio controllo.
 

Episodio 5 - L'avventura continua

I bambini raggiungono una singolare fabbrica dove si producono macchinari inutilizzabili ed energia. Al suo interno troveranno intrappolato Andromon, il quale una volta libero grazie all'aiuto dei ragazzi li attaccherà. Agumon e Gabumon digievolveranno in Greymon e Garurumon nel tentativo di sconfiggere il nemico, ma senza risultato. Così Tentomon digievolverà in Kabuterimon che colpendo al piede Andromon permetterà al Black Gear di uscire dal suo corpo. Una volta ristabilito Andromon indicherà ai bambini un tunnel per uscire dalla fabbrica.
 

Episodio 6 - Ora tocca a te, Palmon

Seguendo un passaggio sotterraneo, i bambini e i loro fedeli compagni vengono attacca dagli abitanti della fogna i Numemon. Riescono a scappare soltanto uscendo nella città dei giocattoli, dove vengono catturati da un Digimon ad orsacchiotto chiamato Monzaemon. Quando uno dei Numemon innamorato di Mimi correrà in sua difesa, Palmon si digievolve in Togemon, un cactus gigante che riescerà a sconfiggere Monzaemon, controllato sino ad allora da un Black Gear.
 

Episodio 7 - La furia di Gomamon

I sette bambini con il loro Digimon indecisi sullo scalare il monte Mughen per poter ottenere la completa visuale dell'isola, finiscono per litigare. Così Joe deciderà di scalare la montagna da solo. Seguito dal suo fedele Gomamon, vengono attaccati da Unimo, il quale è controllato da un Black Gear. Sora, Tai e Birdramon accorrono in loro aiuto, ma quando Birdramon è sconfitto, Gomamon digievolve in Ikkakumon. Sconfitto Unimon, i bambini con i loro  Digimon raggiungono la vetta della montagna dove purtroppo scoprono che intorno a loro, c'è soltanto mare..
 

Episodio 8 - Devimon, messaggero delle tenebre

Leomon, un Digimon buono, è colpito da un Black Gear, trasformandolo così in un servo di Devimon. Devimon ordinerà a Leomon e Ogremon, un'altro Digimon cattivo, di attaccare i "bambini prescelti". I quali nel frattempo sono giunti ad un albergo di lusso, ma lo stesso hotel è soltanto un'illusione di Devimon che ne approfitta per attaccare i ragazzi. Soltanto grazie al Digivice di Tai i ragazzi saranno salvi, infatti grazie a quest'ultimo Leomon riacquisterà la sua vera natura e terrà impegnato Ogremon mentre i ragazzi insieme ai loro Digimon scapperanno.
 

Episodio 9 - Il cuore caldo di Frigimon

Tai e Agumon isolati nella Terra dei Ghiacci, incontrano Frigimon il quale è controllato dal Black Gear. Una volta liberato dall'ingranaggio nero, Frigimon mostrerà a Tai ed Agumon la via per un'altra isola dei ghiacci; dove si ricongiungeranno con Matt e Gabumon. Mentre i due ragazzi decideranno sul da farsi, verranno attaccati  da Mojomon vittima del Black Gear. Agumon e Gabumon digievolveranno in Greymon e Garurumon sconfiggendo Mojomon. Al termine del combattimento i due ragazzi si accorgeranno che il Monte Mughen è vicino.
 

Episodio 10 - Il Guardiano Centarumon

Mimi e Palmon vengono avvicinate da Sukamon e Chuumon, due Digimon che vogliono baciare Mimi. Fuggendo, incontreranno Tentomon ed Izzy; il quale è intento a decifrare dei geroglifici di antiche rovine. Mentre Mimi e Tentomon si allontaneranno per le rovine vengono attaccati  da Centarumon, un Digimon sotto il controllo del Black Gear.  L'intervento di Izzy permetterà a Centarumon di ritornare in se. Il quale per gratitudine  racconterà ai bambini che il loro Digivice è un'arma da usare contro il Male. Leomon arriverà per attaccare i ragazzi, ma riusciranno a scappare grazie a Centarumon.
 

Episodio 11 - Bakemon, spirito danzante

Portati alla deriva dal mare, Joe e Gomamon verranno attaccati da Ogremon, ma grazie alla trasformazione di Gomamon in Ikkakumon il perfido Digimon verrà sconfitto. I due stremati dalla battaglia sprofonderanno in mare, ma saranno salvati da Sora e Biyomon. Continuando il loro viaggio, i quattro raggiungeranno una chiesa dove verranno fatti prigionieri da un Digimon fantasma, Bakemon. Biyomon e Gomamon digievolveranno, ma a salvare la situazione ci penserà Joe. Così Joe e Sora insieme ai loro Digimon continueranno il loro viaggio alla ricerca degli altri ragazzi.
 

Episodio 12 - Io e Patamon

T.K. e Patamon ancora separati dal resto del gruppo giungono nel villaggio della Rinascita, il quale è pieno di colori, divertimenti e baby Digimon. Electomon, guardiano dei piccolo Digimon e della Digi- uova scoperti i due intrusi combatte contro Patamon. Ma quando i piccoli Digimon inizieranno a piangere T.K. convincerà i due Digimon a sfidarsi in un combattimento leale; che vedrà la vittoria di Patamon. Come conseguenza del combattimento T.K. Patamon  e Electomon impareranno il valore di essere uniti e capiranno che finche i loro cuori non saranno uniti l'isola rimarrà divisa.
 

Episodio 13 - Finalmente tocca a Patamon

T.K. e Patamon vengono attaccati da Leomon e Ogremon; intanto il resto del gruppo arriva in suo soccorso e grazie a i Digivice riescono a distruggere il Black Gear di Leomon. Il quale racconta ai ragazzi la legenda dei "Digi-Destini" che porteranno la pace sull'isola. Così i ragazzi capiscono che potranno tornare a casa soltanto dopo aver sconfitto Devimon. Ma quest'ultimo si mostrerà tropo potente per loro, così Patamon digievolverà in Angemon  che grazie ai suoi poteri sacri sconfiggerà Devimon e si ritrasformerà in un Digi-uovo.
 

Episodio 14 - Attraverso l'oceano

Gennai chiederà ai bambini di raggiungere il continente di Serba per sconfiggere i nuovi nemici e per permettere ai "sette prescelti" di trovare i Digimedaglioni che permetteranno ai propri Digimon di trasformarsi e  raggiungere un livello superiore. Così i bambini partiranno su di una zattera per raggiungere Serba  ma verranno inghiottiti da Whamon. Dopo aver rimosso il Black Gear dalla pancia di Whamon, il Digimon li condurrà dove Devimon ha nascosto i Digimedaglioni.
 

Episodio 15 - Etemon e la prima Digipietra

Arrivati sul continente di Serba i bambini insieme ai loro Digimon troveranno un villaggio di Pagumon, imbroglioni che, con l'aiuto dei Gazimon hanno imprigionato i veri abitanti; i Koromon. I ragazzi riusciranno a salvare i Koromon e a cacciare i Pagumon ma Etemon e la sua rete oscura distruggerà il villaggio. Così i vari Digimon tenteranno di digievolversi, ma saranno bloccati  dal rock 'n' roll di Etemon. Così i bambini prescelti saranno costretti a rifugiarsi in una grotta dove Tai troverà la sua Digipietra: quello del coraggio.
 

Episodio 16 - Greymon contro Etemon

Izzy spiegherà ai suoi amici che per digievolversi ogni Digimon ha bisogno di due cose: che il suo compagno sia in pericolo ed un pieno di energia. Poiché è l'unico del gruppo ad avere la Digipietra, Tai deciderà di far mangiare Agumon in modo che possa avere l'energia sufficiente per digievolversi nella sua forma successiva. Intanto il gruppo raggiungerà il Coliseum dove Joe pensa che possa trovare la sua Digipietra. Qui purtroppo verranno attaccati da un Greymon "malvagio" inviato da Etemon permettendo così ad Agumon di digievolversi purtroppo nella forma sbagliata: SkullGreymon. Ma terminato lo scontro a causa dell'eccessiva energia persa  il Digimon di Tai ritornerà al livello base. Joe troverà la sua Digipietra.
 

Episodio 17 - La Digipietra della Sincerità

I ragazzi mentre attraverseranno un arido deserto , saranno informati da Gennai che per far digievolvere il proprio Digimon, ne devono avere cura. Improvvisamente apparirà dinanzi ai loro occhi una nave da crociera che imbarcherà i ragazzi, ma il tutto è opera di Cockatrimon un Digimon "malvagio" inviato da Etemon. Cockatrimon catturerà i ragazzi con i loro Digimon lasciando le ragazze che interverranno con Birdramon e Togemon. Una volta liberati i propri compagni, i ragazzi fuggiranno, ma Cockatrimon li inseguirà con la propria nave, finché non si scontrerà con un cactus gigante che distruggerà la nave. Mimi troverà la propria Digipietra: quella della Sincerità.
 

Episodio 18 - Piximon

I ragazzi con i loro Digimon continueranno ad attraversare il deserto, quando saranno attaccati da Kuwagamon. Agumon ancora impaurito dalla propria esperienza come SkullGreymon non riuscirà a digievolversi e le cose sembreranno mettersi male sino all'intervento di Piximon un famoso addestratore di Digimon. Piximon inviterà i ragazzi nella propria abitazione ed addestrerà i loro amici. Tyramon un Digimon malvagio inviato da Etemon attaccherà i ragazzi, ma grazie all'addestramento, Agumon digievolverà in Greymon sconfiggendo così il nemico. Matt ed Izzy troveranno le proprie Digipietre.
 

Episodio 19 - Datamon e il labirinto

Rispondendo ad una richiesta di aiuto inviata via e-mail, i "bambini prescelti" impareranno il segreto di DigiWorld il quale in realtà è un programma per il computer dove ogni cosa (compresi i ragazzi) non sono altro che dati. Tutto ciò indurrà Tai a pensare di essere invulnerabile poiché il suo corpo è sulla terra. I ragazzi troveranno la sorgente dell'e-mail, Datamon, un robot che è stato fatto prigioniero da Etemon ormai da parecchi anni. Una volta liberato, Datamon rapirà Sora e Biyomon; Tai accorrerà in loro aiuto ma una volta avvisato da Izzy sul fatto che in caso di morte il suo corpo morirebbe anche sulla terra, inizia ad esitare. Intanto Datamon fugge con Sora e Biyomon.
 

Episodio 20 - Il momento giusto

Partiti alla ricerca di Sora e Biyomon i ragazzi giungeranno alla piramide di Datamon. Mentre gli altri aspetteranno fuori, Tai  e Agumon entreranno al suo interno dove Datamon è impegnato a fare una copia di Sora. Tai e Sora riusciranno a scappare grazie all'arriva di Etemon giunto li per combattere Datamon il quale farà  cadere il proprio rivale in un buco nero. Etemon riuscirà ad uscirne e si lancerà contro i ragazzi. Greymon digievolverà in Metalgreymon riuscendo così a sconfiggere Etemon. Ma tutto ciò provocherà la caduta di  Tai ed Agumon nel vortice dimensionale del buco nero.
 

Episodio 21 - Ritorno a Casa

Tai ed Agumon caduti nel vortice dimensionale del buco nero, giungeranno sulla terra. Tai corso subito a casa incontrerà la sorella Kari che sembra sapere di DigiWorld. Inoltre Tai si accorgerà che molti Digimon malvagi, sfruttando il passaggio stanno giungendo sulla terra seminando il panico. Koromon sarà così costretto a trasformarsi in Agumon per poter difendere il proprio amico. Anche se Tai avrebbe desiderato rimanere con la sorella sarà costretto a seguire Agumon e quindi a ritornare a DigiWorld.
 

Episodio 22 - L'astuto Demidevimon

Ritornati a DigiWorld, Tai ed Agumon partiranno alla ricerca degli altri. Trovano Tokomon il quale li informa che gli altri sono partiti alla loro ricerca. Racconterà che lui e T.K. hanno incontrato un nuovo Digimon, Demidevimon che li ha spinti a litigare e a seguire strade differenti. Così Tai, Agumon e Tokomon troveranno T.K. e Demidevimon e Tai proverà a convincere T.K. e Tokomon a fare pace. Il nuovo Digimon capirà di aver perso la sua influenza su T.K. ed allora li convincerà a mangiare dei funghi velenosi. Ma i ragazzi saranno avvertiti da una voce femminile misteriosa (Sora) che permetterà a Tai e agli altri di capire che Demidevimon non è dalla loro parte. Così Tokomon digievolverà in Patamon ed allontanerà il nemico.
 

Episodio 23 - Un grande amico

Matt e Gabumon troveranno Joe impegnato nella cucina di Vegiemon intento a lavorare per poter così pagare il suo debito. Ma una serie di sfortune allungheranno il debito di Joe; il quale non è a conoscenza che Demidevimon ha ordinato a Vegiemon di trattenere Joe per sempre. Fortunatamente arriveranno T.K. e Tai i quali sveleranno i piani di Demidevimon. Durante la battaglia Joe si scarificherà per difendere T.K. così Gabumon digievolverà prima in Garurumon e successivamente nella sua ultima forma Weregarurumon. Sconfitto il nemico i ragazzi con i loro inseparabili Digimon, partiranno alla ricerca di Mimi e gli altri.
 

Episodio 24 - Il trionfo di MegaKabuterimon

Alla ricerca di Gennai, Izzy  e Tentomon improvvisamente cadranno in un baratro. Vademon ingannerà Izzy facendosi così consegnare la sua curiosità insieme cha al suo Digimedaglione. Tentomon capirà che rischia di perdere Izzy così tornerà al suo stato primario. Il quale aiuterà il suo amico a riconquistare la sua insieme al Digimedaglione che nel frattempo era caduto nelle mani di Demidevimon. Tentomon digievolverà in MegaKabuterimon riuscendo a  sconfiggere Vademon. All'uscita del pozzo i due incontreranno T.K. e Matt.
 

Episodio 25 - Il re tiranno

Tai, Joe e i loro Digimon giungeranno in castello dove Mimi è trattata come un principessa da particolari esseri rana chiamati Gekomon. Secondo i quali soltanto lei con il suo canto è in grado di risvegliare il loro re: ShogunGekomon. Quando Tai e Joe provano a farle cambiare idea, Mimi li fa imprigionare.  Fortunatamente durante la notte  si accorgerà del suo cambiamento e dopo aver chiesto scusa a tutti risveglierà ShogunGekomon; il quale arrabbiato per il suo risveglio attaccherà i ragazzi.  Ci penserà MetalGreymon a mettere tutto a posto.
 

Episodio 26 - Garudamon, ali gloriose

Dopo essersi riuniti, i ragazzi riusciranno a trovare Sora, la quale racconterà che secondo Demidevimon il suo Digimedaglione non si illuminerà mai perché lei non ha ricevuto abbastanza amore nella sua vita. Vedendo tutti i bambini riuniti Demidevimon avviserà Myotismon il quale comparirà ed attaccherà i ragazzi. Così Sora riuscirà a capire che la madre le ha sempre voluto bene permettendo al suo Digimedaglione di illuminarsi. Biyomon digievolverà Garudamon riuscendo ad allontanare Myotismon il quale avvertirà i ragazzi che si rincontreranno molto presto.
 

Episodio 27 - Il castello incantato

Gennai informerà i bambini dell'esistenza di un ottavo "bambino prescelto" che vive in Giappone. Progettando la cattura dell'ottavo bambino, Myotismon aprirà un passaggio che attraverso il proprio castello conduce direttamente sulla Terra. I ragazzi cercheranno di impedire a Myotismon e alle sue truppe di varcare la soglia che conduce all'altro mondo; ma Gatomon riuscirà a chiudere il passaggio prima dell'arrivo dei bambini.
 

Episodio 28 - Di corsa verso il Giappone

I ragazzi rimasti a guardare mentre Myotismon e le sue truppe attraversavano il passaggio per il mondo degli umani, si recheranno nella casa di Gennai in fondo al lago. Il quale consegnerà loro dieci carte la cui giusta combinazione li permetterà di raggiungere il loro mondo. Ritornati al castello di Myotismon i ragazzi saranno costretti ad affrontare i Digimon di guardia; mentre Izzy provvederà alla decifra tura delle carte. Soltanto all'ultimo minuto Izzy scoprirà il valore delle carte permettendo a tutti di ritornare a casa.
 

Episodio 29 - Ritorno al campo estivo

Ritornati al campo estivo, i ragazzi insieme ai loro Digimon partono alla ricerca dell'ottavo bambino. Si recheranno così nel quartiere di Igarigaoca ma improvvisamente vengono attaccati dagli scagnozzi di Myotismon. Così ognuno di loro ricorderà di aver vissuto in quel quartiere e di esser andato via per colpa dello scoppio di una bomba; ma in realtà si trattava di una battaglia tra Digimon. Così Izzy suggerirà di cercare li l'ottavo bambino.
 

Episodio 30 - Di nuovo a casa

Nel tentativo di tornare a casa, i ragazzi  prenderanno la metropolitana mentre i loro Digimon fingeranno di essere dei finti animaletti. Purtroppo durante il viaggio i ragazzi si addormenteranno e salteranno la loro fermata; ma fortunatamente riusciranno ad ottenere un passaggio da Duane. Il quale accidentalmente spingerà Izzy da un ponte ma grazie all'intervento di Motimon digevoluto in Tentomon riuscirà a salvarsi.
 

Episodio 31 - L'ottavo Digivice

Tai si chiederà se non sia la sorella Kari l'ottavo bambini prescelto, intanto il suo gatto Mico spingerà accidentalmente l'ottavo Digivice dal balcone cercando successivamente di ritrovarlo. Izzy verrà avvertito da Gennai dell'arrivo in città di un nuovo Digimon: Raremon; cercherà di contattare gli altri ma li troverà tutti dormendo. Così lui e Tentomon affronteranno Raremon da solo, ma durante il combattimento il Digivice di Izzy si illuminerà indicando che l'ottavo bambino è vicino. Tentomon digevoluto in Kubuterimon sconfiggerà Raremon mentre Mico perderà il Digivice il quale verrà preso da un corvo.
 
 

Episodio 32 - Battaglia alla torre di Tokyo

Mentre la città è ormai scossa dagli avvistamenti di mostri e dallo strano tempo, Tai egli altri perlustrano il quartiere di Shibaura alla ricerca dell'ottavo bambino. Intanto Kari incontrerà nel parco Gatomon  la quale è sicura che si Kari la bambina prescelta. Mini e Sora verranno attaccate da SkullMeramon così Agumon si digievolverà in MetalGreymon sconfiggendo il nemico.
 
 
 

Episodio 33 - Due Digimon nella città dei bambini

Matt accompagnerà il fratello T.K. a casa quando durante il tragitto T.K. e Patamon litigheranno provocando così la fuga di quest'ultimo. T.K., Matt e Gabumon partiranno alla ricerca del loro amico, finché non incontreranno due scagnozzi di Myotismon: Pumpkinmon e Gotsumon. Purtroppo quando Myotismon si accorgerà che i suoi due Digimon non hanno il coraggio di attaccare i bambini li farà scomparire. Grazie all'intervento di Patamon digevoluto in Angemon Myotismon verrà messo in fuga.
 

Episodio 34 - Il misterioso destino di Gatomon

Gatomon continuerà a controllare Kari convinta che sia il bambino prescelto, anche se non ha le prove ed intanto, proverà a ricordare qualcosa prima del suo incontro con Myotismon. Wizardmon troverà l'ottavo Digivice ma non lo consegnerà a Myotismon, infatti si recherà da Gatomon aiutandola a ricordare il proprio passato ed in particolar modo a ricordare la persona che stava attendendo. Agumon interverrà pensando che Kari sia in pericolo, ma Gatomon li dimostrerà che Kari è l'ottavo bambino prescelto e lei il suo Digimon.
 

Episodio 35 - La nebbia si dirada...

Una fitta nebbia isolerà Odaiba, mentre Myotismon continuerà la ricerca dell'ottavo bambino con l'aiuto di Pahantomon e i suoi scagnozzi, i quali cattureranno tutti gli abitanti del quartiere inclusi Sora e Mimi. Joe e T.K. intanto tenteranno di entrare ad Odaiba. Nel frattempo Sora farà ascoltare agli scagnozzi di Phantomon un nastro contenente una canzona contro gli spiriti; annientandoli. Ma questo sarà temporaneo infatti con l'arrivo di Dark Tyrannomon, Togemon si digievolverà in Lillymon. Sora intanto si ricongiungerà con la madre, mentre Lillymon si troverà ad affrontare Myotismon.
 

Episodio 36 - Tutti per uno...

Tai correrà a salvare i propri genitori tenuti prigionieri da Myotismon; intanto Izzy riceverà da Gennai le istruzioni per creare una barriera Digitale per poter proteggere la propria famiglia dall'attacco dei Bakemon. Intanto Joe e T.K. proveranno ad entrare ad Odaiba, ma saranno attaccati da MegaSeadromon. Grazie all'intervento di Ikkakumon digevoluto in Zudomon il nemico verrà sconfitto; inoltre i due ritroveranno Wizardmon che è in possesso dell'ottavo Digimedaglione. Phantomon seguirà Sora sino al nascondiglio di Kari con l'intento di attaccare l'ottavo bambino. Sentendosi responsabile di tutto, Kari confesserà di essere le la prescelta e sarà così condotta da Myotismon.
 

Episodio 37 - Una grande scoperta

Kari è stata appena catturata da Myotismon. Wizardmon informerà gli altri che è fondamentale fornire a Kari l'ottavo Digimedaglione, infatti senza di quello Myotismon non potrà essere sconfitto. I Digimon dei ragazzi tutti nella loro forma evoluta cercheranno di fermare Myotismon, ma senza successo. Così il malvagio Myotismon attaccherà Kari e Gatomon, le quali saranno salve grazie all'intervento di Wizardmon che le proteggerà con il proprio corpo, purtroppo andando incontro alla morte. Tai riuscirà a fornire a Kari il  proprio Digivice che permetterà a Gatomon di digievolvere in Angewomon e di colpire Myotismon con la sua freccia celeste.
 

Episodio 38 - Pronti a tutto

Gennai scoprirà una profezia che potrebbe salvare il mondo reale e quello di DigiWorld, se Izzy e gli altri saranno in grado di decifrarla. La profezia inizierà dicendo, che in principio nel cielo ci saranno pipistrelli, gli abitanti di Odaiba invocheranno a gran voce il re dei Digimon, ma il male potrà esser sconfitto grazie agli angeli. Cosi Patamon e Gatomon si digievolveranno in Angemon e Angewomon e scoccheranno una  freccia di luce verso Tai e Matt, permettendo ad Agumon e Gabumon di megadigievolversi in War Greymon e MetalGarurumon.
 

Episodio 39 - Due mondi uniti

Anche se raggiunto il livello mega, War Greymon e MetalGarurumon non saranno in gradi di sconfiggere VenonMyotismon. Tutto ciò finche i Digimon ed i ragazzi uniranno le loro forze facendolo così scomparire.  Quando i ragazzi alzeranno gli occhi rimarranno stupiti nel vedere che il cielo è squarciato da immagini di un'altro continente. Izzy riuscirà a capire che quel continente è DigiWorld, così i ragazzi decidono di ripartire per poter così stabilire le cose nei due Mondi.
 

Episodio 40 - Un nuovo Mondo

I ragazzi e i loro Digimon ritorneranno a DigiWorld dove Chuumon gli informerà che quattro Black Masters hanno trasferito DigiWorld nella Montagna Spirale ed hanno intenzione di conquistare tutto il resto. I Ragazzi saranno attaccati da MetalSeadramon così i loro Digimon digievolveranno ma non potranno sconfiggerlo poiché è l'ultimo Digimon. Incontreranno il secondo Dark Masters, Machinedramon ma anche in questo caso non potranno combatterlo. Il terzo Dark Masters, Puppetmon controllerà i ragazzi come dei burattini e li spingerà a conoscer il quarto Dark Master, Piedmon. Grazie all'intervento di Piximon i ragazzi riusciranno a scappare.
 

Episodio 41 - La vendetta di MetalSeadramon

Piximon sacrificherà se stesso per salvare i ragazzi da Piedmon.  Intanto i "bambini prescelti" ritorneranno sulla spiaggia di MetalSeadramon dove verranno attaccati da Shellmon che verrà sconfitto con facilità. MetalSeadramon invierà un suo scagnozzo, Scorpiomon il quale insieme al Dark Masters per poco non sconfiggono i ragazzi. I quali verranno salvati da Togemon ed Ikkakumon digevoluti in Lyllimon e Zudomon. Intanto Tai e gli altri inizieranno a dubitare sulle capacità dei loro compagni.
 

Episodio 42 - Grazie Whamon

Dopo la fuga dei ragazzi e l'apparizione di Whamon, MetalSeadramon e il suo scagnozzo Divermon saranno intenzionati a ritrovarli.. Intanto Izzy scoprirà che War Greymon è in grado si sconfiggere MetalSeadramon. Divermon troverà ed attaccherà Whamon intraprendendo con lui un duello marino. I ragazzi non saranno in grado di seguirlo così grazie al sonar di Izzy  troveranno un tunnel dove mettersi in salvo; tuttavia MetalSeadramon riuscirà ad intercettarli. Whamon seguirà i ragazzi attraverso il tunnel sino a giungere su una spiaggia, dove verranno attaccati da MetalSeadramon. Agumon digievolverà in War Greymon. La puntata terminerà con "To be Continued"....
 

Episodio 43 - Un gioco pericoloso

War Greymon avrà quasi sconfitto MetalSeadramon, ma Whamon nuoterà nella loro direzione e verrà colpito dallo scoppio mortale. MetalSeadramon verrà così sconfitto e Tai si mostrerà eccitato ed impaziente di attaccare gli altri Dark Masters. Intanto Puppetmon escogiterà un piano diabolico per sconfiggere i ragazzi, infatti creerà delle  bambole voodoo ognuna rappresentante uno di loro e separerà Matt e T.K. . Dopo aver accantonato T.K. Puppetmon attaccherà gli altri ragazzi con Kiwimon, ma T.K. riuscirà a distruggere le bamboline  permettendo ai Digimon di sconfiggere Kiwimon. Puppetmon giurerà a Matt e T.K. che si vendicherà.
 

Episodio 44 - Il misterioso Cherrymon

Tai e gli altri partiranno alla ricerca di Matt, che è misteriosamente uscito dal gruppo. Matt sarà incerto del suo ruolo nel gruppo e si mostrerà frustrato dal fatto che gli altri abbiano acquistato maggiore sicura e più confidenza. Cherrymon, un misterioso ed intelligente albero Digimon troverà Matt in una condizione vulnerabile e lo convincerà ad attaccare Tai se vuole migliorare la propria situazione. Nel frattempo, Puppetmon e i suoi scagnozzi, i Grabegemon attaccheranno gli altri ragazzi. Quando nello stupore generale, MetalGarurumon attaccherà Tai, Agumon sarà costretto a combattere.
 

Episodio 45 - WarGreymon contro MetalGarurumon

Matt e Tai inizieranno a litigare. Matt non riuscirà a capire come abbiano fatto gli altri a diventare bambini prescelti, e vorrà andarsene. War Greymon e MetalGarurumon inizieranno a combattere così come i loro compagni. Anche gli altri ragazzi con i loro Digimon inizieranno a litigare. Puppetmon inizierà a ridere perché questo era il suo programma, ma improvvisamente un'entità amichevole entrerà nel corpo di Kari e i ragazzi con i loro Digimon inizieranno a volare . Kari (l'entità) inizierà a spiegare ai ragazzi che ogni Digimedaglione rappresenta la qualità migliore di ogni bambino. Al termine della storia, Kari ritornerà nel suo corpo, mentre Matt deciderà di rimanere solo; Mimi vorrà fermarsi e non proseguire con il gruppo;  insieme a lei rimarrà Joe, mentre gli altri seguiranno per la propria via.
 

Episodio 46 - La vendetta di Etemon

Ogremon verrà inseguito da una tribù di Woodmon intenti a rubarli l'energia; improvvisamente la caduta di una meteora farà scappare i Woodmon. Joe e Mimi troveranno Ogremon gravemente ferito e lo aiuteranno a riprendersi, così il "malvagio" Digimon toccato dalla loro disponibilità, li diverrà amico. Mentre gli altri  ragazzi esploreranno il palazzo di Puppetmon, quest'ultimo troverà Joe e Mimi. Improvvisamente  apparirà Etemon e i due inizieranno a battersi. Tai e gli altri incontreranno nel castello le guardie di Puppetmon che odiano il proprio padrone, così Tai riuscirà a convincerli ad attaccarlo con il cannone. Ogremon confesserà a Mimi e Joe la sua volontà di distruggere Leomon, mentre i ragazzi scovati da MetalEtemon verranno inseguiti nella giungla dove una creatura somigliante a Leomon apparirà all'improvviso.
 

Episodio 47 - Addio Leomon

Mimi e Joe incontreranno SaberLeomon il quale li condurrà in un nascondiglio sicuro insieme ad Ogremon. Li i ragazzi incontreranno Otamamon e Gekomo. Puppetmon si scontrerà con i ragazzi spingendoli verso i RedVegiemon i quali verranno sconfitti. Puppetmon arrabbiato si scaglierà contro i ragazzi; intanto MetalEtemon si confronterà con Leomon il quale sarà costretto a trasformarsi in SaberLeomon. Ikkakumon digevoluto in Zudomon arriverà in suo aiuto. Puppetmon proverà ad arruolare MetalGarurumon nel suo esercito, ma il Digimon di Matt si rifiuterà e distruggerà il Dark Masters. Sul punto di morte Leomon chiederà a Mimi di non piangere, perché si potranno rincontrare nel suo villaggio della Rinascita, il quale nel frattempo è stato distrutto. Ogremon, Mimi e Joe li prometteranno di distruggere i Dark Masters e di ricostruire il villaggio.
 

Episodio 48 - Kari in pericolo

Mentre Tai e gli altri attraverseranno il deserto, Kari verrà colpita da un malore. Tai si mostrerà molto preoccupato poiché alcuni anni prima a causa della sua negligenza, la sorella aveva rischiato la vita. Kabuterimon li condurrà in una città deserta, dove Kari potrà riposarsi; intanto Tai partirà alla ricerca della cura che permetterà alla sorella di star meglio, ma grazie ad Internet, Izzy riuscirà a trovare la giusta medicina, ma involontariamente condurrà verso di loro Machinedramon. Izzy riuscirà a depistare il nemico, permettendo così a lui e a Tai di fuggire. Riusciranno appena in tempo a ricongiungersi con gli altri prima che il loro rifugio venga distrutto da una serie di missili. Improvvisamente apparirà Machinedramon; costringendo i bambini a rifugiarsi in un edificio il quale sarà distrutto dai  suoi colpi.
 

Episodio 49 - La fine di Machinedramon

I ragazzi cadranno nelle fogne al disotto della città di Machinedramon. Sora, Biyomon e Patamon riusciranno a trovare Kari, T.K. e Gatomon. Izzy, Tai e i loro Digimon, saranno ancora dispersi. Cosi Kari e gli altri partiranno alla loro ricerca, ma si imbatteranno in WaruMonzaemon il quale ha reso schiavi i Numeron. Una strana luce emergerà dal Digimedaglione di Kari permettendo ai Digimon di diventare più forti e di oltrepassare il nemico, permettendo così ai Numeron di ritornare liberi. I ragazzi decideranno di continuare a seguire la luce di Kari sperando di ritrovare Tai ed Izzy. Machinedramon infuriato distruggerà WaruMonzaemon e si abbatterà contro i ragazzi nel frattempo ricongiunti. La luce di Kari permetterà a WarGreymon di sconfiggere il penultimo Dark Masters.
 

Episodio 50 - Donne guerriere

Tai e la sua squadra sarà costretta ad affrontare la potente LadyDevimon mentre Sora e T.K. andranno in cerca degli altri. Joe e Mimi incontreranno nel villaggio della Rinascita  Electomon al quale i due chiederanno di appoggiare la loro causa. Ma improvvisamente Joe annuncerà che lui e Gomamon stanno per lasciare temporaneamente il gruppo per poter così trovare la sua via nella vita. Nel frattempo con l'aiuto di MegaKakuterimon, Angewomon riuscirà a sconfiggere LadyDevimon, ma non sarà il momento di festeggiare, a causa dell'arrivo di Piedmon l'ultimo Dark Masters.
 

Episodio 51 - Quando il gioco si fa duro...

Joe e Gomamon partiti alla ricerca di Matt, improvvisamente troveranno la sua barca. Nel frattempo War Greymon continuerà a combattere contro Piedmon ma senza successo. Così i bambini capiranno che per sconfiggere Piedmon dovranno essere tutti uniti. Perso in una caverna, Matt deciderà che lui non è indispensabile per gli altri, ma Gabumon riuscirà a rincuorarlo facendogli capire la propria importanza. Intanto Sora e T.K. riusciranno a trovare la barca di Matt ma Sora si scoraggerà quando non riusciranno a trovare il loro amico. Verrà così risucchiate dalla grotta. Mentre Matt, Joe e Sora cercheranno di uscire dalla grotta, Matt si renderà conto che il tutto è opera della loro depressione che dovranno sconfiggere se vorranno uscire di lì. Superate le loro paure, Matt e gli altri correranno ad aiutare Tai, e i due si renderanno conto di essere più amici che mai.
 

Episodio 52 - L'ultimo scherzo di Piedmon

I bambini con i loro Digimon proveranno a distruggere Piedmon ma quest'ultimo li trasformerà eccezione di Kari e T.K. in dei portachiavi. T.K. chiamerà Angemon che digievolverà in MagnaAngemon che riporterà i bambini alla normalità. Piedmon attaccherà con la sua arma speciale, ma all'improvviso arriverà Mimi con la sua Digimon arma in grado di sconfiggere le forze del male. Gennai informerà i ragazzi che il nemico reale è la forza oscura che ha generato i Dark Masters.. Intanto la terra inizierà a tremare e dal Monte Spirale comparirà una luce.
 

Episodio 53 - Apocalymon

La Montagna Spirale inizierà a sgretolarsi mentre i bambini saranno sospesi nelle tenebre. Gennai spiegherà ai ragazzi che la malvagità che ha creato i Dark Masters è venuta dal Muro di Fuoco. Il saggio racconterà un'antica storia riguardante  la strana esistenza degli esseri che hanno attraversato il misterioso muro. Inoltre racconterà anche che altri bambini prescelti prima di loro, hanno combattuto contro le forze del male; e che la loro chiamata è avvenuta  perché una nuova malvagità è uscita dal Muro del Fuoco con l'intenzione di avvolgere l'intero mondo nelle tenebre. Purtroppo Gennai non riuscirà a svelare l'entità della forza diabolica, ma il nuovo nemico ben presto si mostrerà sotto forma di Apocalymon. Il quale sarà in grado di eseguire tutti i colpi dei Digimon malvagi sino ad allora affrontati dai ragazzi. Apocalymon distruggerà i Digimedaglioni e i Digivice dei ragazzi i quali grazie alla loro fiducia in se stessi,  riusciranno a ripristinare i loro Digimedaglioni e a prepararsi alla battaglia contro Apocalymon.
 

Episodio 54 - addio a un mondo nuovo

Grazie ai loro Digivice i bambini riusciranno a resistere all'ultimo attacco di Apocalymon e quindi a sconfiggerlo. Gennai giungerà a dare la bella notizia della rinascita di DigiWorld a partire dall'isola di File. Dove i ragazzi decideranno di trascorre i loro ultimi giorni delle vacanze estive, poiché a DigiWorld il tempo trascorre più lentamente. Purtroppo Gennai informerà i ragazzi che con la fine di Apocalymon il tempo ha iniziato a scorrer come sulla terra e che hanno poco tempo per varcare il cancello che li ricondurrà a casa. Così ogni bambini sarà costretto a salutarsi con il proprio Digimon anche se T.K. e Kari sanno in qualche modo che si rivedranno presto.